Ну так и утягивай инкременты. Виндовая родная бэкапилка умеет инкрементно. Только там покопаться надо в документации, она по дефолту каждые полгода снова делает полный и начинает гнать инкременты уже к нему.
А что мешает поднять самбу на мелком роутере/эмбеддед железке, а с нее собирать бакапы? А доверять проведения бакапа данных системе подверженной троянам и прочей вирусне как-то не секурно. Как вариант - мелкий линух на соседнем разделе, который грузится по умолчанию, проверяет необходимость проведения бакапа, а далее (kexec?) ntldr/граб. Хотя не уверен, что kexec метод сработает. Хотя если на секурность пофиг - вери какой-нить рар/zip/7z и пихай батник в запланированные задачи.