А это только у меня так?
Поставил на поиграться-посмотреть что нового 9.04 убунту, и теперь в нетбинзах 6.5.1 что-то с высотой панели. На всех дефолтных темах по крайней мере. Посмотреть можно: http://imageshost.ru/links/c3bffb5689e85fa4c314a3dc203e20e5
