Мне надо организовать, обработать и анализировать пару тысяч химичиских структур из PDB (все молекулы содержащие HETATM). Сначала думал организовывать всю работу при помощи текстовых файлов и директорий, но понял, что гораздо умнее организовать это дело при помощи базы данных. Проблема в том, что в принципе, в базах данных я - ни в зуб ногой. Как я понимаю, к любой конвенциональной БД можно прицепить перл/С/?? программы для вытаскивания данных, обработки, и записи новой информации. (Очень важен удобный доступ к координатам всех молекул).
На что еще стоит смотреть при выборе БД? Что читать?
Есть ли у кого-то из вас готовая БД, с готовымы таблицами и данными, которая содержит информацию о молекулах, включая координаты? Поделитесь примерами
