если я понял правильно, то вот так:
root@inet:~# lsof -i | grep java
java 436 resin 4u IPv6 1198924 TCP localhost:2734->localhost:2731 (ESTABLISHED)
java 436 resin 8u IPv6 1199352 TCP *:8080 (LISTEN)
java 436 resin 10u IPv6 1199372 TCP localhost:6802 (LISTEN)
java 1164 resin 4u IPv6 1198924 TCP localhost:2734->localhost:2731 (ESTABLISHED)
java 1164 resin 8u IPv6 1199352 TCP *:8080 (LISTEN)
java 1164 resin 10u IPv6 1199372 TCP localhost:6802 (LISTEN)
............
далее последнии три строчки повторяются много раз. На сколько я понимаю, это связанно с там, что висит много процессов java (веб интерфейс к биллингу cake) эти ветви lsof и выводит.
а по поводу портов, для которых процесс не выводится пишет:
root@inet:~# lsof -i @0.0.0.0:2049
root@inet:~# lsof -i @0.0.0.0:1290
root@inet:~#
точнее ничегно не пишет