firefoxы и поисковые машины

Взможно, если они устанавливаются как плагины или типа того, ты указываешь им не тот каталог для установки...

Мне как-то проще самостоятельно копировать поисковые плагины в директорию
/путь/к/firefox/searchplugins/
И перезапускать браузер. К тому же, когда пишешь свой плагин - это единственный нормальный выход.
ИМХО.

У меня была такая проблема...
Проверь, чтобы пользователь, от которого ты запускаешь второй файрфокс имел права на запись в директории, куда сохраняются поисковые машины.