Настройка GRUB после установки нового ядра

может быть http://www.gnu.org/software/grub/manual/grub.html#savedefault

Блин, что сложного в грубе такого?

info grub - там всё расписано пошагово

Проверьте в Makefile путь к ядру и измените, если надо:
...
#
# INSTALL_PATH specifies where to place the updated kernel and system map
# images. Uncomment if you want to place them anywhere other than root.
#
...

Затем :
make bzImage
make modules
make modules_install

А затем make install все сделает за вас.
Он и symlinks на vmlinuz и т.д. правит - этого я не люблю и восстанавливаю ссылки на старое ядро.

Куда катится мир....