Создавал топик полгода назад, ответа так и не было, а проблема осталась.
http://www.linux.org.ru/forum/desktop/4382766
После перезагрузки режим драйва ставится в нормальный udma4.
hdparm только читает, устанавливать не хочет, ругается на Inappropriate ioctl for device
