Какие есть нативные способы вставить svg в LaTeX'е?

Конвертирование есть в любом случае (когда ты графику вставляешь). Можно только его скрыть.

Посмотри пакет svg (внезапно).

pdf поддерживает только pdf, png и jpeg, так что если драйвер делает pdf, то он съест только эти форматы. Если внезапно pdf будет поддерживать включение svg, то svg тоже будет вставляться.

Самому же TeX/LaTeX глубоко всё равно в каком формате картинка — ему только размеры бокса для вставки нужны.