Openbox и виртуальные десктопы

>объединённые в один виртуальный экран через xrandr.

два отдельных workspace-а на каждый дисплей?

Если я всё правильно понял, то это взаимоисключающие параграфы, не?

В конфиге опенбокса.

каким образом?

Взаимоисключающие параграфы.

То, что ты хочешь, так не называется.

Опиши с точки зрения юзера, чего тебе в текущем виде не хватает.

Эмм. Без понятия. Посмотри в документации. В конфигурационном файле, где задаются правила для приложений, нужно указать соответствие рабочего стола - экрану.