Есть два кататога: A(с файлами aa, bb, cc) и B(aa.diff, bb.diff, cc.diff) как применить diff'ы с одного на другой?

если я правильно понял вопрос, тогда:

cd A
for FF in `find ../B/ -type f -name '*.diff'`; do
patch -p1 < $FF
done

Спасибо!!!