Ну в общем, в каждой из папок корня (почти) находятся важные конфигурационные файлы. /etc - настройки программ, /boot - все, что связано с загрузкой системы и т.д. и т.п.
А чем определяется _важность_ конфига? Для меня, например, важны те, которые относятся к _важным_ _для_меня_ программам. А _важные_ программы - это те, которые позволяют выполнять _важные_ _для_меня_ задачи. Отсюда вывод - если с системой нечего делать, то важных конфигов в ней нет :)