wget

Воспользуйся командой dd:
dd if=file.corrupted of=file bs=5120 count=1

К сожаленью я работая в винде :( Просто знаю, что wget слизан с линукса, надеялся хоть чем-то скачать битую часть файла. Можешь написать подробнее, что и как.

оффтопик

Допустим, нужно скачать 5М начиная с некоторой точки А. Сохраняем копию. Обрезаем файл по точку А. Запускаем wget. Он начинает докачивать. Ждем, пока он скачает скока надо и прерываем. Остаток приклеиваем из копии.

Если есть возможность использования rsync (есть rsync-сервер с нужным файлом), то он скачает лишь битую часть.