За пару лет использования gentoo, в distfiles появилось огромное количество файлов без ебилдов, т.е. просто старых, как без брэйнфака удалить или перенести эти файлы?
я в своё время просидел 4-е года на генту:) для твоей задачи писал скрипт на Perl'e - он парсил portage занося все файлы в массив, а потом просто прочёсывал дистфайлы на соответствие этому массиву, всё лишнее удалялось.