poptop + mysql

poptop никакого отношения к учетным записям не имеет. Он просто запускает после установки GRE тунеля pppd. А вот уже pppd проводит авторизацию. Вроде когда-то я ивдел плагин к pppd для авторизации по базе MySQL, поищите в интернете этот плагин. Но я бы рекомендовал все-таки установить радиус если учетных записей достаточно много, а если их немного то проще скриптом формировать chap-secrets по данным из базы.