Привести бубунту в первоначальное состояние

насчет автомата не в курсе - а ежели без оного, то в Synaptic есть История - откручиваешь ее и смотришь чего там понаставлял

Да вот этого и хотелось избежать, слишком много наустановленно, переустановленно :)

Если /home на отдельном разделе, то проще переустановить, если нет - сделать бекап /home и переустановить, + если не хочешь по новой качать пакеты - сделай бекап /var/cache/apt

Наверное, придется переустанавливать :( Так влом.

сделай бекап образа раздела / чисто установленной системы. есно всякие там /home выноси на отдельный раздел. можежь даже /etc вынести. итого если нужно откатить разворачиваешь образ за 2 минуты без всяких там вопросов. программы которые тебе нужны позарез кидаешь в отдельный текстовик. после переустнановки apt-get install и копипастишь туда всю пачку пакетов которая тебе нужна. В итоге за ~10 минут новенькая система с корректно устнановленными пакетами а главное настроенная. Хотя последний шаг можно пропустить установи минимальный набор пакетов а потом уже делай слепок раздела.