Имхо, кроссовер принципиально не отличается от Wine. У меня нормально работает под вайном вставка средней кнопкой мыши. Под КДЕ если запущен Klipper (иконка "Klipper-управление буфером обмена" на панели) работает и вставка через Shift-Ins/Ctrl-v. Если не ошибаюсь (не пробовал), под GNOME надо запускать Glipper, под другие DE -- соответствующие программы: clipbook, wmcliphist, xfce4-clipman...