Slackware 4.0 - без проблем, используй установку через umsdos-образ (Сам ставил на ~20 машин, все разные и точно с FAT32 - никаких проблем). Кратко почти для любого Linux: создай на FAT32 каталог /linux - только такой (!), затем замонтируй его под umsdos (возможно придется сделать umssync). Монтируешь его, говоришь ставить туда Linux. Потом грузись через loadlin kernel /dev/(раздел_FAT32) (ro или rw - не помню).