Как вы синхронизируете всякие папки и бэкапы?

rsync на внешний hdd

git для текста, rsync для всего остального

Самое простое - это тупо архивировать нужные папки в .tar и отправлять архив куда нужно. Всё это естественно в крон и по расписанию. Если сложнее, то использовать rsync.

Если на внешние носители, то borg неплохо бэкапит для десктопа (инкрементальные, проверки целостности, сжатие и пр.), не требует всяких серверов и хитрых конфигов, но надо почитать доку перед использованием.

borg + webdav

borg + монтирование любых внешних сетевых носителей (nfs, sshfs, ftps)