Можно ли как-то поменять системные шрифты в Wine?

Можно - разрешаю.

Меняй с помощь winetricks или как обычно ложи ручками в windiws/font(s)/

ложи

клади или положи, ты уже определись

Если я положу ручками в windows/fonts, то ничего не поменяется, т.к. система не выбирает новые шрифты. А через winetricks, если не ошибаюсь, невозможно их поменять тоже.

winecfg (там на эту тему что-то было) и regedit.exe (если какой то специфический случай) если у тебя система не меняет, после установки виндовс-фонтов шрифты где-то там (там это где кстати?).

Хотя у меня вид шрифтов меняется после установки нативных виндовс шрифтов в том же winecfg.