При изменении прав исчезают файлы

Ну логично предположить, что ты не догадался от рута залогиниться. Почему? (:

Ну или у тебя там мандатный доступ шалит.

попробуй chmod -R a+rX ./

Кстати ты хочешь 644 для файлов и 755 для каталогов, ты же понимаешь, что так как делаешь ты, нельзя? Если ты залогинился от рута, это всё не имеет значения, да. Ты на самом деле залогинился рутом? Ну тогда мандатный доступ.

и acl...

Первый комментарий: 05.07.2009

За семь лет ты не понял для чего используется разрешение на выполнение для директорий?!

Я пробовал сделать chmod 666 filename

Это что за извращение? Что по твоему мнению должно было произойти?

Да, это был эпичный затуп, надо больше спать. Всем спасибо, я проснулся и включил мозг.

А вот стирать оригинальное сообщение таким образом, как сделал ты, и писать вместо него «я все понял» - это моветон. Мало ли, кому это может оказаться полезным?