Как стартовать Conky?

извиняюсь вот ~/.xinitrc
exec rox -t=TopPanel &
exec rox --pinboard=Default &
exec conky &
exec blackbox

Чувак, ты чего? exec надо только в последней строке.

Никак скорее всего. Или pinboard, или conky.

Если не включена двойная буферизация - попробуй включить, так же попробуй копнуть в сторону own window для коньков (-o еси память не изменяет)...