такая проблема была по-моему с версией 1.2.4 возьми исходники и в файле ./po/ru.po измени строку "Content-Type: text/plain; charset=iso-8859-1\n" на "Content-Type: text/plain; charset=koi8r\n"
Нет, настройки не помогут. У меня такая же гадость была. Тебе придется взять исходники GTK+ и там ручками поправить дефолт-шрифт. Ээээ.... Есть еще один способ, не такой низкоуровневый, но я точно не помню.... Ищи в факах. Удачи.