Удалить из кэша все установленные пакеты.

То есть оставить только те, что не установлены?

Да, именно.

Если я ничего не пропустил, то pacman не умеет так. Только самому костыль писать.

Прискорбно, однако.

Есть же альтернативные чистильщики кеша пакмана. Воможно, какой-нибудь из них и умеет такое.

Чем не устраивает Pacman -Sc?

Но если всё же не устраивает - https://aur.archlinux.org/packages/repo-clean-xz

pacman -Scc