1. ConfigParser (стандартный модуль)
2. ConfigObj, http://www.voidspace.org.uk/python/configobj.html
3. XML (yaml, lxml, minidom) ...
это чисто технически
А принципы организации и разделения config-файлов какие можете назвать?
1. Иерархический (древовидный) - xml
2. Список списков ([section] name=value) - ini
3. Простой список (name=value) - txt
...
Какие недостатки имеет модуль ConfigParser?