[C++][X] Управление курсором

Найди теперь сырцы xdotool.

Хм, а может xdotool из под моей программки запускать?

Ради бога, он не кусается.

Ок, посмотрю

Воспользоваться фичей ядра: uinput (/dev/uinput). Открывается, настраивается и потом можно события для мыши в него писать.