Не совсем понятно что именно имеется в виду, но попробую дать пару советов по работе с emacs при написании java прог (надеюсь это имелось в виду).
1. M-x java-mode
(кстати есть по-моему не во всех версиях)
2. M-x global-font-lock
(в xemacs просто font-lock-mode)
3. M-x global-set-key <return> <какая-то клавиша> <compile>
привязывает команду компиляции к клавише. Стандартно стоит make -k. При большом проекте имеет смысл написать Makefile и компилировать с помощью него. Если проект небольшой (и/или комп не хилый), можно ввести что-то вроде javac *.java.
Щас я все это нарисовал в виде интерактивных команд, но если очень надо, можно оформить в .emacs файле. Но без документации под рукой ничем помочь не могу.