генерация документации для вики

ну навскидку: можно выдать из doxygen в XML а его как-нить хитро отпроцессить..

// wbr

wiki предназначено для редактирования, а смысл данного преобразования есть если преобразования в wiki с исходниками смерджить сможешь автоматом. Впринципе это конечно реализуется, но надо писать парсеры в обе стороны и очень аккуратно писать код.

А смысл одностороннего преобразования комменты кода -> документация wiki не очень мне ясен.

Некоторые вики поддерживают raw html.