sed s/$loginname/$name/g store.html > mod.html;

и сюда же вопрос, как можно sed'ом или ещё чем привести все символы в строке (в переменной) привести к нижнему регистру?

С регистром разобрался, а вот что делать с sed'ом. Как я понял проблема с пробелами в именах пользователей, они в виде "Иванов Иван Иваныч"?

sed 'y/ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ/abcdefghijklmnopqrstuvwxyz/'

> sed 'y/ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ/abcdefghijklmnopqrstuvwxyz/'

можно проще

loginnamelow=`echo "$loginname" | tr '[:upper:]' '[:lower:]'`

> read str;

разве read(1) читает строку не из stdin?

tr - это лишняя сущность

просто не понятно откуда берется второй stdin, если первый берется из файла < $full_file

дай кусок исходного файла и кусок того что должно получится в результате, а то мне кажется твой подход... эм... через пятую точку

> Когда запускаю, получаю:

прежде чем запускать неплохо бы убедится, что команды делают именно то, чего ты от них ждешь, а не писать не знамо что и удивлятся результату

Исходный файл с пользователями:

i.ivanov
Иванов Иван Иваныч
e.petrov
Петров Виктор Сергеевич

Исходный html-файл index.html:

...>i.ivanov<... 
...>e.petrov<...

Должен получится html файл:

...>Иванов Иван Иваныч<... 
...>Петров Виктор Сергеевич<... 

sed s/$loginname/$name/g store.html > mod.html

поменяй на

sed "s/$loginname/$name/g" store.html > mod.html

потому как пробел в $name в первом случае будет разрывать аргумент для sed на два отдельных

> sed "s/$loginname/$name/g" store.html > mod.html

точно, чё то ступил :)

В Линуксе у sed есть ключик -i, чтобы не заморачиваться с переименовыванием файлов.