Если в Гноме поставить на переключение раскладок и CapsLock, и Alt-Shift, а на индикацию альтернативной раскладки индикатор ScrollLock, то при смене раскладок загораются _оба_ индикатора, и ScrollLock и CapsLock, независимо от того, какой кнопкой выполняется переключение. Мне кажется, что более логично при преключении раскладок зажигать только Scroll, а при нажании Shift-Caps (верхний регистр) -- зажигать CapsLock