вот что написана в файле term.el:
if you want custom colors in term.el redefine term-default-fg-color
and term-default-bg-color BEFORE loading it.
эти две переменные доступны для настройки через custom-variable
это строковые переменные, поэтому нужно задавать имя цвета.
но я так и не смог заставить это работать в моем 23 емаксе :-(