Создаем в домашнем каталоге файл: .gtkrc-2.0
Записываем в нем:
GtkMenu::horizontal-padding = X
GtkMenu::vertical-padding = X
Где значения X могут быт 1 или 2 или 3. Соответственно поля больше - курсор не на пунктах меню.
Дополнительные параметры (по желанию)
gtk-menu-popup-delay = 20
gtk-menu-popdown-delay = 20
gtk-menu-bar-popup-delay = 20
Соответственно, чем меньше значение ставим, тем меньше время задержки перед открытие меню...
Перезагружаем Иксы.