Каким образом проследить, куда и какие файлы копирует или изменяет программа при установке? Что-то вроде Uninstaller для Windows. Подробные логи в папке /var/log при установке не пишутся. Посмотрел в менеджере Synaptic свойства установленной программы, удалил все файлы, но параметры программы сохраняются при переустановке.