2 монитора, по рабочему столу на каждом

nvidia-settings

отсутствие технической информации в посте несколько напрягает

nvidia-settings

amdcccle

Xinerama

Xinerama.

xrandr

Никак. «отдельные рабочие столы» и «свободное бегание мышки между ними» - требования несовместимые. Если требуется свободное бегание мышки, то максимум, чего можно добиться - это один большой рабочий стол, занимающий два монитора. В Fedora 13 это поведение по умолчанию, в остальных дистрибутивах настраивается через xrandr или гномовский апплет разрешения экрана.

$ cat .config/xfce4/xinitrc #!/bin/sh

xrandr --output VGA-0 --auto --output DVI-0 --auto --right-of VGA-0

. /etc/xdg/xfce4/xinitrc

а ещё - tint2

в результате имею общий рабочий стол с раздельными таскбарами

http://filebeam.com/7635f84d93f13096a686406d68fd3e02.jpg

активная консолька находится сразу на двух мониторах, принадлежность таскбару (виртуальному монитору) определяется левой верхней точкой окна