На что повлияет смена libqt_2 на libqt_3?

Старые qt-шные проги не будут запускаться и собираться.

А если не менять а добавить libqt_3 это на что то повлияет?

>А если не менять а добавить libqt_3 это на что то повлияет?

Придется ставить/компиллять с суффиксом (ИМХО в данном случае правильнее префикса).

И насколько я понимаю (c KDE-шными приложениями давно не работал), при сборке (или установке) придется править (указывать) пути к конкретной необходимой версии библиотеки.

Вроде как все.

Не обязательно.
У меня они стоят в разных каталогах.
QTDIR стоит на папку с третьим qt.