Вкратце проблема описана здесь http://serverfault.com/questions/443116/cannot-load-from-raid-with-grub Софтовый RAID 1, убунта 12.04, grub 1.99 Был заменен диск, после чего система перестала ребутиться. Грузится только с sdb в degraded mode в ручном режиме и сразу начинает ребилд массива. При попытке загрузки с пункта меню grub без диска (Linux версия, md0) или с sda (Linux версия, /dev/sda) виснет. Нужно починить загрузку, чтобы нормально ребутилось и грузилось с /dev/md0.