Centos 6.2 с php 5.2.17, php некорректно обрабатывает некоторые файлы

Собственно проблема в чём, переношу некоторые сайты со старой машины с win server 2003 на котором стоят apache+php . Обнаружилась проблема, что некоторые сайты некорректно отображаются после переноса. А причина как выяснилась в следующем: в некоторых файлах используется код <?...?> , и php его просто не обрабатывает. Там где используется конструкция <?php...?> всё нормально. Не знал куда написать, а гугл выдаёт совершенно не то что нужно. Где следует копать?