Проблемы при переключении hda -> hdb

>ядро загружается но модули ядро ищет све равно на hda

Это ты как определил? Ядро вроде вобще не ищит модули, там есть всякие modprobe...

Команду lilo давали после изменения lilo.conf ? Что показывает команда mount после загрузки, все разделы монтируются правильно ?

Если установил на hda то изменяй не изменять лило ничего не поможет надо вероятно в сетапе либо через суперблок либо поменять МБР т.е. рагрузится с дискет подмонтировать диск hdb и через сетап (сам этого не делал ) , а через лило все пробовал нисего не получается

что-то похожее у меня было... Lilo не помогает, а там где делал (ASPLinux) asploader нормально все сделал.

Попробуй другой менеджер загрузки.

man mkinitrd