> Может ли rtorrent как-то сам пользоваться 2мя внешними соединениями?

Имелось виду 2 канала в интернет?

если так то советую копать в сторону использования 2 каналов в интернет для вашей OS

http://www.opennet.ru/base/net/2_channel_balancing.txt.html

http://docstore.mik.ua/manuals/ru/LARTC/x348.html

Именно!

Только есть одно но. RTorrent трекеру сообщает внешний ip, а у меня их получается 2. Т.е. все входящие соединения будут на 1 интерфейс