core.???? Зачим они?

> Зачем они?

Для отладки. core - это дамп памяти программы в момент глюка.

> Как ей запретить их создавать?

В bash - прописать в ~/.bash_profile: ulimit -c 0

прямо в корне говоришь... боюсь что ломанули тебя. да и вот эти знаки вопроса "core.????" у файла тоже есть? или это что это?

> прямо в корне говоришь... боюсь что ломанули тебя
Рановато бояться, сперва надо бы вовнутрь core-файла заглянуть. У меня, например, samba при выключении удаленного компа, с которого mount-ил шары, имеет привычку кидать core в корень.