Если BIOS твоего компьютера "видит" флеш-драйв (под "видит" в данном случае надо понимать эмулирует флеш-драйв под винт), то BIOS сможет загрузить с него LILO, а LILO, в свою очередь, initrd и vmlinuz. И всё это будет происходить в режиме.
Дальше можно работать либо исключительно на рамдрайве, либо на флеш-драйве. В последнем случае понадобятся дрова защищённого режима для флеш-драйва (они должны быть на initrd).