Как найти файл?

А не может это быть лог апача: /var/log/httpd/access_log или что-то вроде того?

Если так, то надо запустить logrotate чтобы он его проротейтил. Ну, или просто снести, ежели не жалко, но это не дело -- на постоянной основе нужен logrotate.

du -h /|sort|head -n 10

как-нибудь так попробуй

find / -size +1000000000c

man find