Как установить квоту на запись в файлы? Можно ли через ipchains огроничить пропускную способность входящих и выходящих пакетов???

через ipchains нельзя, через Squid можно

Пропускную способность можно ограничивать с помощью cbq, iptables

с помощью iptables нельзя - ими можно регулировать только количество пакетов в еденицу времени , а это не совсем то .