использование ssh ключа, сгенерированного Putty для доступа с linux

Можно, но это убивает саму идею ssh. Настоятельно рекомендую сгенерировать на другой линуксовой машине новый ключ и использовать его.

Можно, для этого нужно на linux-машине установить putty (да, эта программа есть и под linux) и сконвертировать приватный ключ в формат OpenSSH:

puttygen key.private.putty -O private-openssh -o key.private.openssh

В таком случае возможно из виндовой Putty скопировать новый сгенерированный в linux ssh публичный ключ на удаленный сервер, дописав в .ssh/authorized_key? Чтобы в .ssh/authorized_key присутствовали оба ключа?

Спасибки, не знал, что putty есть и под linux.

Вам нужно сгенерировать ключ на линуксовой машине и добавить его публичную часть на сервер. И у вас все будет работать как должно без всяких костылей. Что-то вроде этого:

$ ssh-keygen -t rsa # На все вопросы можно просто нажимать Enter
$ ssh-copy-id user@servername # копируем публичную часть ключа на линукс сервер

Если нужно скопировать публичный ключ вручную, можно вывести его в консоль:

$ cat ~/.ssh/id_rsa.pub

Еще раз настоятельно рекомендую не делать костыли там, где без них можно обойтись.

Ок, а как я смогу скопировать публичный ключ вручную с виндовой машины на линукс сервер? ssh-copy-id это ведь линукс команда. Просто подключиться наверное через виндовый putty и вручную добавить в ssh/authorized_key публичный ключ, сгенерированный на клиентской линукс машине?

scp

winscp?

PuTTY SCP (PSCP)

Всем спасибо, вроде понял, что к чему.

У вас же есть другой клиент, линуксовый. Вы хотите заходить с него на линуксовый сервер, правильно? Вот на линуксовом клиенте эти команды и выполните. Больше ничего не нужно делать.