Ого. Правила хранятся в памяти. Если тебе нежно сохранять их для того чтобы автоматом загружать после перезагрузки системы, то в чём проблема вбить их в файл и добавить его в автозапуск? О_о
в зависимости от дистрибутива
/etc/init.d/iptables save
сохранит в:
аля RedHat - /etc/sysconfig/iptables
GenToo - /var/lib/iptables/rules-save
после этого при перезагрузке машины правила будут загружаться автоматом
Можно и так как Demetrio советует, только писать надо в соответствующие каталоги и файлы, чтобы потом при загрузке автоматом поднялось.