InnoDB Scalability \ InnoDb multithread \ распараллеливание

Затык на I/O? Смотрите планы и прочие профили, исходя из уже принимайте решение. Нагрузить все ядра - целью не является до тех пор, пока одно или несколько из этих ядер не превратятся в узкое место(на БД случиться примерно никогда, хотя может mariadb особенности показывает)

Озвучь, пожалуйста, цифры: какое железо, запросы, структура таблиц, ну и что для тебя маленькая скорость.

маленькая скорость ... выборки

Пишем скрипт, в котором select * from tablename, где количество записей в tablename «10005000», количество полей varchar(оченьмного) несколько сотен.
Скрипт же у вас один процесс, тут пока все не прочитает, профита не будет. Получаем, маленькую нагрузку на камень, и большое на хранилище + потребление памяти.

маленькая скорость вставки

Тут есть варианты. «Большая любовь» к индексации тех же varchar(оченьмного). insert одной записи может оказаться «долгим», по причине перестройки индексов.
Или другой вариант в духе insert into ... select...

Насколько я понял даже если заставить использовать все ядра - особого профита это не даст и нужно менять логику самих запросов.

Без рассмотрения конкретных запросов, сложно что-то сказать.