Размер контейнера Docker

docker commit — можно добавлять инфу в конкретный контейнер и фиксировать ее.

А зачем отчёты хранить в контейнере ?

В докере всё наслаивается, разные контейнеры на одном образе будут делить один родительский образ, поэтому нет, каждый контейнер не будет занимать больше гигабайта, будет один родительский контейнер в гигабайт и на него будут слои в несколько мегабайтов для каждого твоего контейнера.

Во FreeBSD внутри Jail есть возможность использовать NullFS из основной системы. То есть изолированное окружение не будет ничего весить, кроме объёма полезного наполнения.

По одному из примеров написал Dockerfile на основе openanalytics/r-base контейнера

приличные люди ссылки на dockerfile дают, а не на репу

Можно ли создать какой-нибудь 1 родительский контейнер, который будет содержать всё что нужно и весить много, а к нему цеплять дочерние контейнеры, содержащие только код, и занимающие пару килобайт места?

Это именно то что докер делает из коробки. Почитай про слои.

Посмотри на вывод

docker history <image> 

Он тебе покажет разбивку твоего образа по слоям и размер каждого слоя.

Ну и ещё прочитай про volumes, потому что данные в контейнере вообще-то не хранят, там внутри только движок должен быть, а данные приходят снаружи.

Да уж - ящик сам-в-себе с дверцами и ключом. Вот только от нормальных контейнеров-хранителей отличается тем, что в нём, по сути, хранить ничего нельзя. :)

А в дочерних контейнерах ты что собираешься держать? Если я тебя правильно понял, то тебе нужно пробрасывать volume на хост.

Тут есть немного интересного

PS И да, не нужно тащить образ ОС. Если говорить про питон и жаву, то там есть официальные образы, с минимальным весом, бери их.

Образ с Debian или Centos весит порядка 150Mb. На нем можно не экономить.

А то сначала выберешь alpine, а потом будешь думать как туда поставить нормальную rpm-ку.

Гигабайт у ТС небось из-за некорректной работы с пакетами набегает. Если кеш пакетного менеджера не чистить, то объем и набегает.

В кои веки, я подержу ваш подкол. :)

До меня только сегодня дошло что можно не создавать отдельный контейнер под каждый отчёт, а хранить все отчёты в одном контейнере alpha мой Dockerfile:

# Родительский контейнерю содержит образ: Ubuntu 16.04 LTS with a basic R installation
# https://hub.docker.com/r/openanalytics/r-base/
FROM openanalytics/r-base


# Обратная связь
MAINTAINER ххх


# Основные системные библиотеки
RUN apt-get update && apt-get install -y \
    sudo \
    curl \
    pandoc \
    pandoc-citeproc \
    libcurl4-gnutls-dev \
    libcairo2-dev \
    libxt-dev \
    libssl-dev \
    libssh2-1-dev \
    libssl1.0.0
    
# Библиотеки для R
RUN apt-get update && apt-get install -y \
    unixodbc \
    unixodbc-dev
 
 
# Нужно отдельно настроить драйвер ODBC для MS SQL. Подробное описание что и зачем есть у меня в OneNote
# Пример: https://github.com/Microsoft/mssql-docker/blob/master/linux/mssql-tools/Dockerfile
# adding custom MS repository
RUN curl https://packages.microsoft.com/keys/microsoft.asc | apt-key add -
RUN curl https://packages.microsoft.com/config/ubuntu/16.04/prod.list > /etc/apt/sources.list.d/mssql-release.list
RUN apt-get update && ACCEPT_EULA=Y apt-get install -y msodbcsql 
RUN echo "[SQL Server]\nDescription=Microsoft ODBC Driver 13 for SQL Server\nDriver=/opt/microsoft/msodbcsql/lib64/libmsodbcsql-13.1.so.9.2\nUsageCount=1\n" >> /etc/odbcinst.ini
    
    
# Установка пакетов R
RUN R -e "install.packages(c('rmarkdown', 'shiny', 'shinydashboard', 'DT', 'RODBC', 'digest'), repos='https://cloud.r-project.org/', dependencies = TRUE)"
RUN R -e "install.packages(c('ggplot2', 'labeling', 'leaflet', 'RColorBrewer', 'dplyr'), repos='https://cloud.r-project.org/', dependencies = TRUE)"


# Копируем общие файлы R
RUN mkdir -p /usr/local/include/R
COPY include /usr/local/include/R


# Помещаем отчёты из временной директории в отдельную директорию. Shiny без этого не работает
RUN mkdir /root/DWHDashboard
RUN mkdir /root/GetUser
COPY DWHDashboard /root/DWHDashboard
COPY GetUser /root/GetUser


# Для того чтобы Shiny увидел приложение нужно выполнить 2 команды ниже
COPY Rprofile.site /usr/lib/R/etc/
EXPOSE 3838

Посмотрел я вывод команды docker history, вроде понял. Больше всего места занимают слои с apt-get update и apt-get install

Не знаю насколько мне подойдут volumes, ведь вместе с почти каждым отчётом нужно будет установить новые R пакеты, библиотеки, и прописать пути. Пока буду просто перестраивать контейнер, возможно позже попробую разобраться с этим.

Вопрос решился, всем спасибо за ответы

Вместо

RUN apt-get update
RUN apt-get install package1
RUN apt-get install package2
RUN apt-cache clean all

Надо делать

RUN apt-get update \
     && apt-get install package1 \
     && apt-cache clean all

RUN apt-get update \
     && apt-get install package2 \
     && apt-cache clean all

И аналогично для любых других кешей, чистить кеш надо в том же слое, в каком создаешь.

Просто надо юзать NixOS.