Скорее всего в качестве кодировки базы данных и таблиц указана latin1. Исправить проблему можно с помощью запросов вида alter database и alter table, примерно так
ALTER DATABASE database_name CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_unicode_ci;
ALTER TABLE table_name CONVERT TO CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_unicode_ci;
Где database_name - имя базы данных, а table_name - название таблицы, для которой изменяется кодировка и collation.