У xmms есть плагинчик для вывода чистого тона. Подозреваю, что есть и для mpd. Хотя да-- чистого синуса он не даст, потому что сигнал все равно проходит через усилитель карточки. Короче, rc-цепочки рулят.
ну е мое, еще в древних временах утилита была - sox называется. умеет синусоиду делать и еще до кучи всего. при желании можно скриптовую музычку писать