Добавлю -- или xf86cfg. Это графический конфигуратор XFree86 4.x. По поводу тонкой подстройки рефреша и положения картинки на экране -- читать статью про настройку режимов монитора в XFree86 в разделе "Документация" здесь.
Для новичка самый IMHO простой вариант: запустить под root setup, и в нем выбрать пункт "Настройка видео (или X)" там с минимумом вопросов все настраиваеться.