Известная статья Гугля о жизни винчестестеров, показала отсутствие зависимости смертности от температуры (в пределах нормальной рабочей температуры, что есть максимум 60-70С).
А если волнует, то таки да - вентилятором.
при большой температуре винчестера падает скорость его работы, т.к. тратится время на постоянные рекалибровки голов. это уже заметно при 50 градусах даже.